进京证违章涉及到罚款和扣分的处罚。对于未办理进京证的车辆,若进入限制区域,将按照“机动车违反禁令标志指示”的违法行为进行处理,具体罚款金额为100元,并扣除3分。对于已办理进京证的车辆,若在工作日高峰时段违反交通限制在五环路以内道路行驶,同样视为“机动车违反禁令标志指示”,处罚为100元罚款并记3分。而在非高峰时段,若违反尾号限行规定,则按照“违反限制通行规定”处理,罚款100元。另外,已办理进京证的载货汽车若在6时至24时进入六环路以内道路行驶,也将视为“机动车违反禁令标志指示”,罚款100元并记3分。