5座车超载2人扣几分？

当五座轿车超载两人时，超员比例达到了百分之40，这种情况将按照《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定进行处理。具体来说，驾驶员将被扣除6分，并且需要支付相应的罚款。这是为了维护道路交通的安全与秩序，防止车辆超载可能引发的交通事故。

根据《道路交通安全法》第四十九条的规定，机动车在载人时不得超过其核定的载客人数。这项规定适用于所有机动车，包括客车和货车。对于客车来说，除了不能超过核定的载客人数外，还不能违反规定载货。

此外，《道路交通安全法》第九十二条进一步明确了对超载行为的处罚措施。如果公路客运车辆载客超过额定乘员，将会受到罚款的处罚。同样地，货运机动车如果超过核定载质量或者违反规定载客，也会面临相应的罚款。

综上所述，五座轿车超载两人将被扣除6分并罚款，这是根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定来执行的。驾驶员应当严格遵守交通法规，避免超载等违法行为的发生，以确保自身和他人的安全。