在生物研究领域,酵母单双杂交技术作为研究蛋白相互作用的重要手段,其操作中每个步骤都需仔细把控。以下是关于酵母单双杂交实验中关键注意事项的详细介绍:
质粒与菌株的选择
在双杂交实验中,我们采用pGADT7(AD)和pGBDT7(BD)质粒,以及AH109或Y2Hgold菌株。而在单杂交体系中,通常采用pHIS2质粒与pGADT7,结合Y187菌株,以适应不同的研究需求。对于特殊应用,如金担子素筛选,本文将略过,专注于基础操作的讲解。
双杂交操作步骤
首先,自激活与毒性检测至关重要。Bait基因通常在pGBKT7上构建,注意启动子可能存在的自激活效应,需相应处理。筛选过程中,从SD/-Leu-Trp平板挑选出良好生长的单克隆,然后在2x YPDA培养基中培养并离心,再将菌体接种于四缺平板,观察菌斑形成情况。
结果解读
通过对比平板上的菌斑,我们可以判断目的蛋白的性质。无明显菌斑表示毒性,SD-2与SD-4的对比则揭示自激活或无自激活情况。同时,通过设置对照组,更准确地评估实验结果。
单杂交操作详解
单杂交实验中,pHIS2载体与HIS3报告基因的结合是关键。使用Y187菌株以减少背景表达。转化过程与双杂交类似,但最后一步需将菌液滴在三缺培养基上,并加入3AT以筛选出真正的相互作用。
注意事项
在操作过程中,注意3AT浓度的梯度设置,它有助于区分真实互动和非真实背景。高浓度的3AT有助于排除假阳性,确保实验结果的准确性。 通过这些细致的操作步骤和注意事项,您可以确保酵母单双杂交实验的高效和准确,从而揭示出目标蛋白之间的潜在相互作用。