在野马发布时，另一个可以说影响了野马终生发展的人物出现了，那就是Carroll Shelby（卡罗尔·谢尔比），1961年他使用了一个空手套白狼的把戏，把一台福特的V8发动机装在了英国A.C.汽车的车壳上，打造了一台AC Cobra（一般大家都将它称为谢尔比眼镜蛇），从此眼镜蛇的传奇便从这里开始，这款车型在随后的赛事中拿下了诸多冠军。同时他也受邀与福特合作打造了赛车界的传奇车型--福特GT40，并在1966-1969年连续在勒芒赛场拔得头筹。
除了GT40赛车，谢尔比还帮助福特打造民用版野马GT车型，当时福特是用选装包的形式发售，车主可以定制自己的车型，1964年6月，福特推出了一款最大功率为275马力的4.7L V8发动机版本（即谢尔比GT350），客户可花442.6美元你就可以获得这款发动机，当时采用这款发动机的车型0-96km/h只需要6秒多，而1/4英里直线加速时间只需14秒。
到了1965年，福特对野马的动力系统进行了一些改进，推出包括了一台3.3L直列6缸发动机，其最大功率为122马力，最大扭矩为258牛·米。另外一台为4.7L的V8发动机，最大功率为213马力，最大扭矩达到了382牛·米。同时变速箱也新增加3速自动变速箱可选。除了普通版的两门野马，福特还推出了敞篷和掀背车，1965年10月20日，一台最新款的敞篷版福特Mustang出现在当时世界最高、也是最有象征意义的大楼——纽约帝国大厦86层观景台上。
视频：第一代野马敞篷版的第一位车主自述
1967-1968年，福特野马经过了一次改款，外观变化包括尾灯、侧裙和前进气格栅等，而内饰上则变得更加豪华，采用了更多木纹或金属材质做装饰，并且加装了3点式安全带，音响系统也进行了升级。
动力系统上则是这次野马改款最大的变化，除了对直列6缸发动机和4.7L V8发动机进行重新调校外，1967年福特收购了A.O.汽车公司，随后眼镜蛇的名称出现在福特旗下的GT车型上，从此野马GT350被命名为Shelby Cobra GT350（谢尔比眼镜蛇GT350）。1968年野马还新增了一台雷鸟的6.4L V8发动机，其最大功率可达330马力，最大扭矩为579牛·米。搭载这款发动机的就是著名的谢尔比眼镜蛇GT390，这款车型后来还参演了1968年的电影《警网铁金刚》（Bullitt）。
另外，在1967年，第一台谢尔比眼镜蛇GT500诞生，当时福特为这款车型打造了一台7.0L V8发动机，该发动机的最大功率可达340马力，最大扭矩597牛·米，这样的数据在当时已经完全赶超了对手，成为了当时野马车迷们竞相追逐的车型，这一款车型的诞生可以说把野马的发展推到了巅峰。2000年上映的《极速60秒》电影中，我们还看到了1967年谢尔比眼镜蛇GT500的身影（道具车）。
1969-1970年，第一代福特野马第二次改款，这次改款其最大的变化在外观设计上，尺寸变得更大，同时掀背车型被命名为Sportsroof。另外，还新增加了一款4.1L的直列6缸发动机，其最大功率为157马力，最大扭矩为325牛·米。
1969年野马推出了一款名为Mach 1的性能选装包用于取代此前的GT系列，当时这款选装包销售的非常成功，一年内销售了72458个，该选装包仅可使用在Sportsroof车身上，其发动机罩上被涂成了亚光黑色，加装前/后扰流板、天窗，换装了镀铬排气管，内饰也更加豪华。动力系统上，其标配的是一个5.8L V8发动机，最大功率为253马力，最大扭矩为481牛·米，匹配3速手动变速箱。
俗话说：“物极必反”，这句话也同样适用于当时的美国汽车市场。到了1970年代中东石油危机开始影响到美国油价，再加上美国相关环保法规的出台，有铅汽油被全面禁止使用，在这样的背景下，在60年火爆至极的肌肉车纷纷停产走向消亡，而为了生存，美国各车厂纷纷转变策略，以尺寸更小、重量更轻、发动机排量更小的车型迎合市场需求，当然这包括福特野马。1971年-1973年福特迅速做出策略转变推出第三次改款的野马，在1971年之前福特是把野马往大尺寸、大排量、高性能上去发展，而这次的完全相反。
正因为上面的原因，第一代福特野马的最后一次改款最大的变化就是在动力系统上，首先发动机的排量只剩下4.1L、5.0L和5.8L三种，到了1973年，4.1L直列6缸发动机的最大功率只剩下了99马力，5.0L V8发动机的最大功率为142马力，5.8L V8发动机的最大功率也只有179马力。但是即便这样还是不能化解野马的危机，于是这也催生了第二代野马的到来。
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