★ 发动机差异
马自达3与福克斯同出于福特C1底盘（还包括VOLVO S40），从发动机结构上看，1.6和2.0的发动机都同样是直列四缸自然吸气双顶置凸轮轴，压缩比均为10，是倾向于高转速表现的调教。而1.6的发动机与2.0相比，取消了VIS可变进气歧管和电子节气门，只有VVT可变气门和VICS可变涡流系统，不仅在动力上与2.0发动机有明显差距，燃油经济性方面当然也有差别。
| 发动机 | 马自达3 1.6 MT标准型 | 马自达3 2.0 MT标准型 |
| 排量(cc)： | 1598 | 1999 |
| 排量(L)： | 1.6 | 2.0 |
| 工作方式： | 自然吸气 | 自然吸气 |
| 气缸排列型式： | L | L |
| 汽缸数： | 4 | 4 |
| 每缸气门数： | 4 | 4 |
| 压缩比： | 10 | 10 |
| 气门结构： | DOHC | DOHC |
| 马力： | 107 | 150 |
| 最大功率(kW)： | 79 | 110 |
| 最大功率转速： | 6000 | 6500 |
| 最大扭矩(N·m)： | 146 | 182 |
| 最大扭矩转速(rpm)： | 4000 | 4500 |
| 发动机特有技术： | S-VT(VVT)、VTCS | S-VT(VVT)、VIS、VTSC、电子控制节气阀(ECT) |
1.6L发动机的厂家代号为Z6V，只有菲律宾的1.6L马自达3发动机是同一个型号名称。而欧洲、美洲以及中国台湾1.6L马自达3发动机型号名称都是MZR，跟国内2.0L车型搭载的MZR 2.0发动机名称相同，而这款2.0发动机正是Mazda6 2.0车型上所使用的同一款。
尽管马自达3 1.6的发动机参数与众多1.6排量车型相比属于中上水平，4000转时达到最大扭矩，但是在时速100公里内，只有发动机转速超过4000转，提速表现才算良好，当车速超过100km/h后，后劲不足加速愈发吃力，而这也是大多数1.6L车型共同的问题。
再看这款型号为MZR LF的2.0发动机，110KW的最大功率在相同2.0排量车型中的表现非常不错，与速腾的1.8T发动机最大功率相同，最大扭矩182N·m/4500rpm，峰值出现得比1.6的晚一点，而高转速发力是它的强项，发动机最高转速可达7250转/分。
★ 配置差异
马自达3 1.6L车型除了在动力上换装了1.6L发动机外，在外观上也与2.0L车型有很大区别，其中包括前脸为黑色网状格栅，没有前雾灯和镀铬排气管，后尾灯由透明灯罩改为红色灯罩并取消了运动天线，而在配置上则缺失了随速助力转向、真皮挡把等。
|
配置差异 |
马自达3 1.6MT标准型 |
马自达3 2.0MT标准型 |
| VIS可变进气歧管 |
- |
● |
| 电子节气门 | - | ● |
| 随速转向助力 | - | ● |
| 轮胎规格 |
195/65R15 |
205/55R16 |
| 运动前后保险杠\侧扰流裙 |
- |
● |
| 运动天线 | - | ● |
| 光亮型排气尾管 | - | ● |
| 前雾灯 | - | ● |
| 真皮方向盘 |
- |
● |
| 真皮挡把 |
- |
● |
| 喇叭数目 | 4 |
6 |
上表即为马自达3 1.6MT标准型和2.0MT标准型之间的具体配置差异，而对于1.6AT和2.0AT车型之间的配置差异也大同小异。
1.6车型助力转向系统为HPAS（发动机转速感应式液压动力辅助转向系统），缺少电子助力的液压转向系统，也无法通过车速变化进行助力调整，因此在低速时方向盘手感比2.0车型稍重，在高速时手感相对于2.0车型偏轻而缺乏韧性。（注：所谓的HPAS发动机转速感应式液压动力辅助转向系统，其实就是普通的助力转向，并不能随着车速的升高或降低而自动调整助力的轻重，因此不要被这种超长的名称所迷惑。）
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