●菲亚特集团全面接手
1993年，菲亚特集团将玛莎拉蒂全盘收入账下，并打算帮助玛莎拉蒂继续研发新车，如此一来，不仅玛莎拉蒂品牌得到了完整保留，企业还拥有充足资金来进行研发生产工作，玛莎拉蒂也因此再次渡过难关。不过在收购玛莎拉蒂品牌后，菲亚特集团并没有立即展开行动，而是在此后将玛莎拉蒂转卖给了旗下品牌法拉利。
1997年7月，菲亚特集团将玛莎拉蒂50%的股份出售给法拉利，并于两年后将玛莎拉蒂股份全盘让出，法拉利也由此获得了对玛莎拉蒂的全盘控制权。我们都知道，从上世纪二三十年代开始法拉利便是玛莎拉蒂的“死对头”，无论汽车赛事还是民用车领域，法拉利与玛莎拉蒂之间始终存在着竞争关系，然而当这两家公司的收购关系达成后，人们看到的却是另外一番景象。
法拉利首先对玛莎拉蒂旗下产品进行梳理，舍弃了一批价值不高或已经停产的产品，并确定了其未来将定位于豪华运动品牌，与法拉利本身加以区分。除此之外，在法拉利的帮助下，玛莎拉蒂迅速建立新工厂，以替代早在40年代便开始服役的老旧生产线，可以说是法拉利将身处困境的玛莎拉蒂重新拉回正轨，为世界留存了这样一个百年汽车品牌。
据说为了进一步给产品增加技术含量，玛莎拉蒂还曾与大众集团进行过谈判，希望能与大众展开技术合作，将奥迪的quattro四驱系统添加到玛莎拉蒂总裁生产线中。然而当时大众集团刚刚收购兰博基尼与布加迪这两家超跑品牌，与玛莎拉蒂、法拉利形成了一定程度的竞争关系，共享四驱系统自然也就成了天方夜谭，最终这项谈判以玛莎拉蒂的全面失败而告终。
1998年，玛莎拉蒂推出了一台全新的双门Coupe跑车，这款名为3200 GT的跑车外观由Italdesign Giugiaro公司执笔设计，内饰则由Enrico Fumia负责。被法拉利公司收购后，玛莎拉蒂的造型设计似乎有了质的飞跃，大量灵动、弯曲的线条和谐融入到相对紧凑的车身上，整车前长后短的比例设计以及大角度溜背造型让它在时尚帅气中更透露出了它的性能取向，前脸椭圆形大灯及扁平“大嘴”则是标志性的经典设计。除此之外，部分车型采用的“归去来器”样式条带状LED尾灯也堪称亮点。
动力方面，3200 GT与总裁及Shamal共享那台3.2L V8双涡轮增压发动机，最大功率达到了惊人的370马力，最大扭矩491N·m，0-100km/h加速时间仅需4.6秒，匹配恰到好处的6速手动变速箱，当年这台3200 GT将优雅、性能、操控结合得天衣无缝，并因此而受到追捧。虽然玛莎拉蒂在其仅仅量产四年后便推出了替代车型，但它依旧给人们留下了深刻印象，据统计，四年时间内玛莎拉蒂总共生产了4795台3200 GT跑车。
为了加快产品更新换代速度，充分与发展快速的豪华运动型车市场接轨，玛莎拉蒂在3200 GT上市不足四年时便推出替代车型Coupe与Spyder，2001年法兰克福车展上，两款玛莎拉蒂新车首次亮相，并于次年底特律车展正式上市。其实从名字上我们便不难看出，它们分别代表两门四座硬顶跑车及两门两座敞篷跑车，且均基于3200 GT打造，许多业内人士或资深车迷习惯叫它们4200 GT。
这个名字的由来不无道理，这两款新车在车身形式、外观设计方面与3200 GT的差别不大，它们之间最显著的区别便是隐藏在发动机舱盖下方的“大心脏”，玛莎拉蒂用一台动力更加强劲的4.2L V8自然吸气发动机替代了那台在出镜率很高的3.2L发动机，这两款车的最大功率也提升至更加夸张的390马力。2002年3月，玛莎拉蒂Spyder登陆美国市场，两个月后Coupe也正式在美国销售，这标志着在沉寂近11年后，玛莎拉蒂豪华运动型车重返北美市场。
除去更加强劲的动力，玛莎拉蒂Coupe/Spyder在设计方面也充分展现出相较于3200 GT的进步，其中双门硬顶版车身尺寸为4523mm×1822mm×1305mm，轴距2660mm。这样的车身尺寸足够四个人舒服的坐在车里，而这也被当时很多业内人士称为“第一台能够真正坐上四个人的玛莎拉蒂双门跑车”，在实用性上它将保时捷911、捷豹XKR这样的竞争对手甩在了身后。
随着时间进入21世纪，玛莎拉蒂产品线被精简压缩，最后只剩下Coupe/Spyder系列、总裁系列及一些产量极小的概念车、赛车产品。在当时玛莎拉蒂产品阵营中，总裁无疑是最重要，也最具有代表性的系列车型，它的更新换代不仅是玛莎拉蒂设计师们的第一要务，更影响着品牌未来的发展道路。
2003年9月，由宾尼法利纳操刀设计的第五代总裁于当年法兰克福车展正式亮相，在汽车设计大师的描绘下，它的造型相较上一代有了翻天覆地的变化，而它也奠定了未来很长一段时间内总裁系列的设计风格。首先令人耳目一新的便是整车圆润平缓的线条，削去棱角的总裁变得更加稳重大方，也更符合一台豪华汽车的造型风格。车头椭圆形镀铬前格栅的设计被保留下来，尺寸不大的组合式大灯并没有抢了三叉戟的风头，整车看上去依旧帅气，却多了份稳重与低调，那个标志性的三孔散热口设计恰到好处的出现在这台玛莎拉蒂总裁身上。
五代总裁车身尺寸达到5052mm×1895mm×1438mm，轴距3064mm，这样的庞大的车身尺寸为乘客提供了近乎奢侈的车内空间。此外五代总裁在内饰方面的设计同样讲求大方稳重，内饰整体采用深浅拼接配色，木条装饰的三辐式方向盘多多少少留存了一丝运动基因，中控台上方石英钟与随处可见的木条装饰则凸显了它的豪华与高级感。
不过千万别以为它只是个老老实实为老板服务的豪华轿车，第五代总裁搭载的同样是那台4.2L V8自然吸气发动机，只不过应用在总裁上的这台发动机最大功率被调高至400马力，由于有着超过两吨的车重，总裁的0-100km/h加速时间在5.3秒左右，最高时速可达275km/h。只要你需要，它随时可以让司机和后排VIP乘客疯狂起来。据说仅是2006年一年，玛莎拉蒂便卖掉了超过5000台总裁轿车。
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